目的:考核军队医疗资源配置系统效率.方法:采用数据包络分析(data envelopment analysis, DEA)、随机前沿成本模型(stochastic frontier cost model,Frontier模型)与秩相关检验方法,对某区域内3个地区23所军队医院进行包括配置效率与技术效率的系统效率测算研究.结果:军队医疗资源服务量与负荷不足,总体服务量与负荷水平较低,与资源增长趋势相反;军队医疗资源微观技术效率、配置效率与系统效率低下,技术低效率与配置低效率存在一定的相关性,配置低效率是主要因素,医院技术低效率损失可由当地配置效率低下部分解释.医院的平均技术低效率损失为30.45％,总医院技术效率最高,平均低效率损失为23.56％;中心医院效率最低,平均低效率损失为33.33％;驻军医院平均低效率损失为28.63％.各医院的技术低效率损失分布在20％～40％之间.结论:加强军队医疗资源宏观配置布局与结构的合理性,是提高军队医疗资源配置效率、以及系统效率的主要措施.