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| 基因芯片法对丙型肝炎病毒RNA的基因型分析 |
| 赵伟;万建民;刘伟;刘全俊;张林;刘新钰;张汉荣 |
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| (南京农业大学生命科学与技术学院,南京农业大学生命科学与技术学院,南京市第二医院肝病研究室,南京市第二医院肝病研究室,南京市第二医院肝病研究室,南京市第二医院肝病研究室,南京市第二医院肝病研究室 南京 210003;南京市第二医院肝病研究室,南京 210003 ,南京 210003 ,南京 210003 ,南京 210003 ,南京 210003 ,南京 210003 ,南京 210003) |
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| 摘要: |
| 目的:制备丙型肝炎病毒(HCV)基因的分型诊断芯片,检测其对丙型肝炎患者血清HCV RNA基因分型诊断的价值。方法:根据HCV 5’端非编码区末端(5’UTR)和C区设计引物和特异性探针,将设计的20条特异性寡核苷酸探针用核苷酸合成仪合成后,配制成50μmol/ml的点样液,用点样仪点到特殊处理的玻片介质上,制成HCV基因分型诊断芯片。收集HCV RNA阳性的丙型肝炎患者血清30份作为实验组,健康人血清30份作为对照组。用荧光定量PCR仪对两组血清进行HCV RNA定量检测,实验组血清HCV RNA含量均大于500 copies/ml,对照组血清HCV RNA均为阴性。两组血清进行HCV RNA分离纯化、逆转录反应、巢式PCR扩增后,分别用基因芯片与核酸序列测定法进行双盲HCV基因分型检测。结果:实验组血清基因诊断芯片检测均为阳性;基因分型1b型23例,3a型2例,3b型1例,2a型1例,2b型1例,混合型1b+2a 1例,1b+3b型1例;核酸序列测定分型1b型25例,3a型2例,3b型1例,2a型1例,2b型1例;两种方法检测的基因分型符合率为93.3％。对照组血清基因芯片检测均阴性。结论:制备的HVC基因诊断芯片可以用于检测血清HCV RNA,并进行基因诊断分型,准确率较高。 |
| 关键词: 基因芯片 丙型肝炎病毒 基因型 |
| DOI： |
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