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| 应用表达谱芯片研究胶质母细胞瘤相关基因的表达及功能(英文) |
| 陈菊祥;卢亦成;骆纯;胡国汉;楼美清;吴小军;李瑶;应康 |
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| (第二军医大学长征医院神经外科上海市神经外科研究所,第二军医大学长征医院神经外科上海市神经外科研究所,第二军医大学长征医院神经外科上海市神经外科研究所,第二军医大学长征医院神经外科上海市神经外科研究所,第二军医大学长征医院神经外科上海市神经外科研究所,第二军医大学长征医院神经外科上海市神经外科研究所,复旦大学生命科学学院遗传学研究所,复旦大学生命科学学院遗传学研究所 上海 200003 ,上海 200003 ,上海 200003 ,上海 200003 ,上海 200003 ,上海 200003 ,上海...) |
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| 摘要: |
| 目的:应用基因表达谱芯片筛选研究人脑胶质母细胞瘤发生,发展中相关基因的表达及生物信息分析功能。方法:采用含13939条基因(设置173个对照点)的BioStarH140S型表达谱芯片;用改良的"一步法"抽提2例正常脑及6例胶质母细胞瘤组织总RNA,制备杂交探针;杂交芯片后用ScanArray4000扫描芯片荧光信号,提取正常脑及胶质母细胞瘤组织差异基因;对差异基因进行生物信息分析,初步分类及Northern杂交研究。结果:按照差异显著标准,在胶质母细胞瘤中共有198条(1.42％)基因表达差异显著,其中77条(0.55％)表达上调,121条(0.87％)表达下调,55条新基IN尚未在GenBank登录;生物信息分析发现肿瘤相关基因与细胞信号和传递蛋白、代谢、蛋白翻译合成、细胞骨架和运动、免疫、原癌基因和抑癌基因、细胞周期、细胞凋亡等9类基因密切相关;Northern杂交结果与表达谱芯片一致。结论:基因表达谱芯片可低成本、高通量、高效率筛选胶质瘤相关基因,并为基因群功能研究提供了方向;本研究结果有助于揭示胶质母细胞瘤分子机制,为指导肿瘤的临床诊断、治疗和预后判断提供依据。 |
| 关键词: 胶质母细胞瘤 基因芯片 基因表达 |
| DOI： |
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