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利用生物信息学鉴定新发现的膜联蛋白亚家庭anx32
颜宏利,孙树汉,陈蕊雯
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摘要:
目的:对抗原基因cC1进行结构分析和初步功能研究.方法:利用网上生物信息学软件进行cC1的一级结构、二级结构分析,同源建模预测三级结构.白陶土部分凝血活酶时间(KPTT)检测重组蛋白GST-anx32的抗凝血活性.结果:cC1在核酸水平和氨基酸水平均与膜联蛋白基因同源, 具有4个同源结构区域,且每一个同源区域均具有膜联蛋白的典型motif "G-X-G-T(38 residues)-D/E".抗凝血实验表明大肠杆菌表达的谷胱甘肽转移酶-cC1融合蛋白具有很强的抗凝血活性.结论:抗原基因cC1具有膜联蛋白家族的典型特征,但与已知的31个亚家族氨基酸序列的同源性均低于48%,因此是一个新的膜联蛋白亚家族成员,命名为膜联蛋白32(anx32).为进一步研究其生理功能及核酸疫苗pcDNA3-γcC1诱导囊尾蚴细胞凋亡的分子机制打下了基础.
关键词:  生物信息学、膜联蛋白、同源建模、抗凝药
DOI:
基金项目:
Application of bioinformatics analysis in identifying a novel annexin subfamily-anx32
颜宏利,孙树汉,陈蕊雯
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Abstract:
Key words: